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ChIP-DIP映射提醒数百种蛋白质与DNA的结兼并辨认多种基因调控元件—小柯机器人—科学网

发表时间: 2024-12-20 09:11:29 作者: 稀释液

  美国加州理工学院Mitchell Guttman团队发现,ChIP-DIP映射提醒数百种蛋白质与DNA的结兼并辨认多种基因调控元件。2024年11月25日,《天然遗传学》杂志在线宣布了这项效果。

  研讨人员表明,基因表达经过不计其数种调控蛋白质在精确基因组区域的动态定位来调控。了解这一细胞类型特异性的进程一直是一个长时间方针,但由于DNA蛋白质映射办法一般一次研讨一种蛋白质,这一方针依然具有挑战性。

  为了处理这一问题,研讨人员开发了平行染色质免疫沉淀(ChIP-DIP),在单次试验中生成数百种不同调控蛋白质的全基因组地图。ChIP-DIP在大规划蛋白质池(160种蛋白质)中生成高度精确的地图,适用于一切类别的DNA结合蛋白,包含润饰组蛋白、染色质调理因子和转录因子,并可以一起掩盖多种条件。

  首要,研讨人员运用ChIP-DIP测量了LPS影响后原代树突状细胞中的时间性染色质动态。接下来,研讨人员探究了界说不同类别调控元件的组蛋白润饰的定量组合,并表征了这些元件在人类和小鼠细胞系中的功用活性。整体而言,ChIP-DIP可以在任何分子生物学试验室和试验体系中生成特定布景的蛋白质定位图谱,并具有协作规划的潜力。